pitagora-network.github.io

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ログを見る
再起動
bowtie とか samtools とかのパスを通す
新しいツールを入れる
ヒストリーからワークフローを作る
既存のワークフローをインポートする
Dockerがらみのコマンド(未整理)

sudo docker build

sudo docker images

sudo docker run

sudo docker login

sudo docker push

sudo docker images

[galaxy@localhost ~]$ sudo docker run -it maskot1977/bridger:0.1.0 bash

[galaxy@localhost test]$ sudo docker run -v `pwd`:/data -w /data maskot1977/bridger:0.1.0 /src/Bridger_r2014-12-01/Bridger.pl –seqType fq –right /src/Bridger_r2014-12-01/sample_test/reads.right.fq.gz –left /src/Bridger_r2014-12-01/sample_test/reads.left.fq.gz –CPU 8

[galaxy@localhost test]$ sudo docker push maskot1977/bridger:0.1.0

[galaxy@localhost test]$ sudo docker tag a8d2ce8c481a maskot/bridger:0.1.0

[galaxy@localhost test]$ sudo docker push maskot/bridger:0.1.0