概要
MeGAPを用いて微生物メタゲノムのアノテーションを行う（※前半まで。CLUSTを用いたアライメント以降は未実装）
- TestToolShed： 「megap_pre（Owner:emihat）」をインストール
- テストデータ： 適当な微生物メタゲノムのFastqを「GetData」（例：DRR018420）
- アノテーションデータ： hg38とPhiX174のリファレンス配列Fastaを「GetData」（※テストではhg38はchr22のみ使用）
- ワークフロー： 以下のデータを指定して実行
- Step1のInput dataset： 2のテストデータを指定
- Step2,3のInput dataset： 3のアノテーションデータを指定
入力ファイル
fastq
出力ファイル
フロー図
[ WF.png](/File:MeGAP_WF.png "wikilink")
テスト方法