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主旨

ツールやワークフローを持ち寄って、次のバージョンのImageに加える（図）
- 実際には、加えるための手順を作って、Imageの管理者と共有する
- 同時に、Wikiに加えるツールやワークフローの説明を記載する
プロジェクトを改善するためのフィードバックを収集する
- 解析プラットフォーム管理に役立つ技術ネタを共有する
- Galaxy以外のソフトウェアを扱っていく可能性について議論する

Variant Calling（w/ 新海さん）
- ワークフロー化する部分を決定 Admin Variant Calling 01
- これからやること
  - いただいた Wrapper を Tool Shed に登録
  - GATK を取ってきて、いただいた Wrapper を動作確認
  - GATK を取ってくる Dependency Package を作る？
  - テストデータを新海さんに用意してもらう
Sailfish（w/ 芳村さん）
- Sailfish の Dependency をつくった Admin RNA-seq 02
- これからやること
  - 芳村さんの Wrapper に Dependency Package を参照させる
  - 芳村さんの Wrapper を Tool Shed に登録
  - 芳村さんの Workflow を動作確認
  - テストデータを芳村さんに用意してもらう
ChIP-seq（w/ 仲木さん）
- Sicer をインストール、動作未確認、これに従ってやる
- モチーフロゴを表示する JavaScript いつか作れたら嬉しい

前回から現在まで: bam2readcount

edgeR

enrichment / PPI / heatmap / time-course plot visualization のあたりの script を連動させ、実際に Galaxy 上で動くことを確認する作業を行った。

Galaxy とは少々話がずれるが、理研 IMS で、RNA-seq/ChIP-seq 用 webpage (RefDIC) 開発者である土方さん、当時のラボボスの小原先生に RefDIC 仕様の公開は OK であるという了承をもらったので、芳村さんとお話したときに RIKEN 和光の cloud でもし活用・参考にして頂く分には問題ないということになった。

今後やること: workflow の解説を記載、Tool dependencies の記載 (個人用 Evernote に書いているので、基本はその記事を転用する)、パワーポイントプレゼンテーション資料の作成、ToolShed repository を介した software の登録

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ワークフロー図関連
- レイアウト：幅は800px固定、２段組にして、左にテキスト、右にフロー図（幅400px)で変更していく（作業中）
- メタ情報については、各ワークフロー図作成後に修正して掲載。現段階では削除。
- 長崎さんに情報提供のご依頼
- 芳村さんにページ更新依頼
講堂レイアウトの確認（配置図案作成）
初期登録者に懇親会の参加確認メール