| 10:00-10:15 | 今日の作業確認 |
| 10:15-18:00 | ツールの開発 |
| 17:30-18:00 | 今日のまとめ （Skype 参加可） |
| 18:00-20:30 | 有識者会議 |
基本パッケージ、python2.7.11、galaxy, pitagora-galaxy, docker, pycryptoのインストール, mysqlのイニシャライズ
fab -u galaxy -p XXXX --host=192.168.184.138 config_pre
システム環境の設定
fab -u galaxy -p XXXX --host=192.168.184.138 config_system
(ロゴの変更部等は時間切れで未実装)
インストールしているライブラリは下記
base_packages = [
'build-essential', 'checkinstall', # Gnu's essential tool to build
# build-essential contains 'libc6-dev', 'dpkg-dev', 'g++', 'gcc', 'make'
'sqlite3', 'libsqlite3-dev', 'zlib1g', 'zlib1g-dev',
'libbz2-1.0', 'bzip2-doc', 'libbz2-dev',
'libssl-dev', 'libssl-doc',
'ncurses-doc', 'libncurses-dev', 'libncursesw5-dev',
'libtinfo-dev',
'mysql-client', 'libmysqlclient-dev',
'acpid',
'libreadline-gplv2-dev', 'tk-dev', 'libgdbm-dev',
'git', 'vsftpd', 'vim', 'wget',
'php7.0', 'php7.0-mbstring',
'php-mysql',
'default-jre', 'gfortran',
'patch',
'apt-transport-https', 'ca-certificates',
# Following file should be modified as linux-image-extra-$(uname -r)
'linux-image-extra-4.4.0-21-generic',
]
Docker のインストール部分
def _sudo(items):
# base module for apt-get install
sudo('apt-get update')
for item in items:
sudo('apt-get install {}'.format(item))
docker_packages = [
# install docker package
'docker-engine',
]
def install_docker():
sudo('apt-key adv --keyserver hkp://p80.pool.sks-keyservers.net:80 --recv-keys 58118E89F3A912897C070ADBF76221572C52609D')
sudo('echo “deb https://apt.dockerproject.org/repo ubuntu-xenial main” > /etc/apt/sources.list.d/docker.list')
sudo('apt-get update')
_sudo(docker_packages)
sudo('apt-get purge lxc-docker')
sudo('apt-cache policy docker-engine')
