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主旨

  1. ツールやワークフローを持ち寄って仮想マシンに加える (図)
    • 実際には、加えるための手順を作って、仮想マシンの管理者と共有する
    • 同時に、Wiki に新しいツールやワークフローの説明を記載する
  2. プロジェクトを改善するためのフィードバックを収集する
    • 解析プラットフォーム管理に役立つ技術ネタを共有する
    • Galaxy 以外のソフトウェアを扱っていく可能性について議論する

スケジュール

ランチの時間は部屋に誰もいなくなる可能性があるので、施錠の関係上、この前後にお越し頂けるとスムーズです。

   
10:00-10:15 今日の作業確認
10:15-11:30 ツールの開発
11:30-12:30 ランチ
12:30-18:00 ツールの開発
18:00-18:30 今日のまとめ (Skype 参加可)
18:30- 有識者会議

内容

大田
末竹
小坂
佐藤
那須野
新海
浅井
池田

Galaxy toolのXML schemaについての続編

丹生
石井
松尾
中岡
菅波

作成したdockerイメージ(vsearch)の軽量化についてご相談→ 末竹さんがAlpineベースで作り直していただきました。ありがとうございました。conda周りが重いので、from alpine-javajdk等からインストールが良いかも とのことですので、後ほど自分でも動作確認もしつつ試してみたいと思います。 https://hub.docker.com/r/petadimensionlab/docker_16s_vsearch/

iibmp2018用に作成したスライドについて大田さんにご相談→問題点・まとめをもう少し増やす(dockerを使わなかった場合の苦労等)

鈴木(ひ)
山中
コピペ用