Pitagora Meetup 2020-03
概要
- 日時: 2020年03月26日(木)10:00 〜 19:00
- 場所: フルリモート
- オンライン参加 (Zoom) のURLは Pitagora Slack で告知します
- Slack 参加希望の方は下の連絡先までどうぞ。
- 連絡先: 大田 t.ohta [at] dbcls.rois.ac.jp
- Skype ID:pitagora-network (最新バージョンのSkypeの使用を推奨)
タイムテーブル
途中参加、途中退出は自由です。*印が付いている時間がオンラインでの集合目安時間です。その後は繋いだままでもいいですし、一度切って作業に集中しても構いません。
Time |
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10:00-10:15 |
今日の作業確認* |
10:15-11:00 |
各自作業 |
11:00-11:30 |
update session* |
11:30-13:00 |
各自作業 |
13:00-14:00 |
ランチ* |
14:00-17:00 |
開発とディスカッション |
17:00-17:30 |
ラップアップ* |
19:00- |
有識者会議* |
ミートアップの主旨
- データ解析ツール・ワークフローを共有する
- ソフトウェアをコンテナ化する
- Galaxy や CWL などを使ってツール定義、ワークフロー定義を書く
- ドキュメントを書いて GitHub で公開する
- 共有されたツールやワークフローを実行する
- うまくいったこと、うまくいかなかったことを記録する
- 技術情報を共有する
- 関連OSSプロジェクトにコミットする
- SNSで質問する
- hashtag をつけて twitter で
- プロジェクトの Gitter channel があればそこで聞く
- Issueを立てる
- Pull Request を送る
- その他データ解析に関わる人々の日々の暮らしが豊かになる開発を進める
まとめ
大田
- covid19 virtual BioHackathon 関連の連絡とか
- https://github.com/virtual-biohackathons/covid-19-bh20
- 某病院の某ベンダーのシステムから出てきた邪悪なデータをパースしている
- 邪悪
- 邪悪
- 大事なことなので2回
- 末竹さんが作ってくれたシステムにロードして動作確認をしたりしていた
- 首都がロックダウンされても仕事に支障はないけど落ち着かないですね
山中
- Virtual BH について考えました
- 余談
- バンコクは非常事態宣言が出たのでひまです
- スワブ届いたらサンプリング始めます
- FedEx が再配達してくれません
那須野
- 外出の自粛要請が出ている中、年度末の納品処理 1/4 を済ませました(残りは来週)
池田
- zoomのVirtual Backgroundのために桜の映像を撮影した
- しかし、背景にあまり変化が無いのでいまいち
- そのうえちょっとCPU負荷が高く1cpuをほぼ専有してしまう(Macbook pro mid 2014, corei7)
- 負荷が高いので本体がうるさくて耳障り
- Virtual Happy Hour 用に コロナビールを買ってきた…
丹生
- 不要不急の外出を避けるため、ここ一ヶ月は自宅で作業している
- 論文をまだ書いている
- https://escience2020.cmc.osaka-u.ac.jp
- 開催は9月だが、本当に開催されるのか
- COMPが切れたので食べるものに困っている
鈴木
松尾(エア、足跡だけ残します)
- 某社に転職したけど、このご時世ずっとリモートで研修とかやってます
- 初日に無駄に高性能なThinkPadが配られてキレそうになった
- WEB会議が得意になった
- Azureの専門家というニッチすぎるポジションになった
- クラウドの部門なのですが、なんでよりによってAzure。。。
- どうもAzureの経験を持っているということ(他にそういう人がいなかったので)で拾われた模様
- クラウド、仮想化あたりの技術は使いそうなので引き続き勉強します
- 4月からはシステム移行(Azureへ)プロジェクトの配属になる予定
- 社内で好きな仕事を選べるので、まあおいおい楽しそうな仕事を探してみます
- コロナが落ち着いたら飲みにいきましょう
末竹
- 家にいるのが飽きてきた
- 納品関係が終わったので、今週は off の予定
- ボスと今後の研究計画に話した結果、HCI とか関係なく自分が有意義だと思うやつをやればいいよって言われた
- こういう workflow とか system の話は、どこらへんの学会に出せばいいのか今度教えて下さい
- 書類仕事とかがめっちゃ溜まっていてアレ
- 9月にマルタの学会が通ったのだが、無理ではとなっている