t.ohta [at] dbcls.rois.ac.jp
途中参加、途中退出は自由です。*印が付いている時間がオンラインでの集合目安時間です。その後は繋いだままでもいいですし、一度切って作業に集中しても構いません。
Time | |
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10:00-10:15 | 今日の作業確認* |
10:15-11:00 | 各自作業 |
11:00-11:30 | update session* |
11:30-13:00 | 各自作業 |
13:00-14:00 | ランチ* |
14:00-17:00 | 開発とディスカッション |
17:00-17:30 | ラップアップ* |
19:00- | 有識者会議* |
prepare_job
(最初に割当計画を立てる)と prepare_job
(実際に確保する) の仮実装はできたのでこれから繋げるcwl-metrics fetch tsv
でステップごとのメトリクスに分解して表示してくれるcwl_file
などにファイル名ではなくてワークフロー自体の中身がほしい
cwl
とか?)cwl_file
(ファイル名のみ)だと、ワークフローなどを一意に識別できないcwltool --pack
で、ひとまとめにした CWL が出力できる
$graph
を使った込み入った CWL…
$ docker run -v /dbdata --name dbstore ubuntu /bin/bash
$ docker run --rm --volumes-from dbstore -v $(pwd):/backup ubuntu tar cvf /backup/backup.tar /dbdata
MetaSUB論文 [“Global Genetic Cartography of Urban Metagenomes and Anti-Microbial Resistance | bioRxiv”](https://doi.org/10.1101/724526) |