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Pitagora Meetup 2023-12

途中参加、途中退出は自由です。初めて参加される方はぜひ過ごし方ガイドをご覧ください。

データ解析ツール・ワークフローを共有する
- ソフトウェアをコンテナ化する
- Galaxy や CWL などを使ってツール定義、ワークフロー定義を書く
- ドキュメントを書いて GitHub で公開する
共有されたツールやワークフローを実行する
- うまくいったこと、うまくいかなかったことを記録する
技術情報を共有する
- twitter に post する
- ブログを書く
関連OSSプロジェクトにコミットする
- SNSで質問する
  - hashtag をつけて twitter で
- プロジェクトの Gitter channel があればそこで聞く
- Issueを立てる
- Pull Request を送る
その他データ解析に関わる人々の日々の暮らしが豊かになる開発を進める

ToDo: BlueSky bot を作る
- https://bsky.app
- Env secret vs repo secret in github actions
  - https://stackoverflow.com/questions/65957197/difference-between-githubs-environment-and-repository-secrets
- できた: https://github.com/inutano/beersky
CWL の告知をする bluesky bot を作る
- CWL は今 mastodon で (Michaelが) 更新している
  - https://floss.social/@cwl
- Bot は以下をやる
  - post の一覧を取得する
  - まだ repost してない post を bluesky に post する
mastodon API を叩く
- https://floss.social/api/v1/accounts/lookup?acct=cwl を叩くとユーザの情報が取れるのでここから id を取得する (109522718177073248)
- https://floss.social//api/v1/accounts/109522718177073248/statuses を叩くと post の一覧が取れる
- id を見ながら

石井メモ：福井さん曰く、vagrantなどで、消えて良いノードにセットアップするような感じ。ログインしてそこに作る感じ。kubespray(公式傘下)を別ノードにたてて、そこからどこかに作成するイメージ。一応、アップグレードも対応してくれているらしい。

お土産を家に忘れてきた。。。
- 1月まで賞味期限があったきがするので、時間の日程によっては、、、
CWLのoutputファイルの操作をするために InitialWorkDirRequirement絡みを試している
- CWL の requirements 一巡り: InitialWorkDirRequirement
初歩的なところから作り始めている。
- 存在しないファイルやディレクトリを作れるようになった。
- https://github.com/manabuishii/cwl-samples-2023/tree/main/change_outputdir
今後やりたい
- 存在しないディレクトリを複数作成し、その中それぞれに、複数の結果ファイルを書き出したい。
- 最終的には、任意の入力ディレクトリ？の中に出力ディレクトリを作りたい
  - 全部コピーするのに適さない量のファイルに対してもおこないたいので、どのように、stagingするのかは、cwltool以外でもテストする必要がある。 -
何かわからないが、テザリングで8GBくらい使っている。
- かつて経験したことはない。
- OSのアップデートっぽい。