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Pitagora Meetup 2024-04

概要

• 日時： 2024年4月11日（木） 14:30 〜 19:00
• 場所：
  • オンサイト会場: アマゾン ウェブ サービス ジャパン合同会社 (東京都品川区 目黒セントラルスクエア)
    • 人数制限があるため、オフライン参加を希望する方はお問い合わせください
    • COVID19 感染対策にご協力ください。
  • オンライン会場:
    • Discord: Pitagora / Workflow Meetup Japan サーバ

問い合わせ

• 幹事: 大田 tazro.ohta [at] chiba-u.jp

タイムテーブル

途中参加、途中退出は自由です。初めて参加される方はぜひ 過ごし方ガイド をご覧ください。

Time
14:30-15:00	今日の作業確認
15:00-16:00	AWS セミナー
16:00-18:00	開発とディスカッション
18:00-19:00	ラップアップ
19:00-	有識者会議

ミートアップの主旨

• AWS で提供されている生命科学系の解析プラットフォームについての最新の知見を共有する
• データ解析ツール・ワークフローを共有する
  • ソフトウェアをコンテナ化する
  • Galaxy や CWL などを使ってツール定義、ワークフロー定義を書く
  • ドキュメントを書いて GitHub で公開する
• 共有されたツールやワークフローを実行する
  • うまくいったこと、うまくいかなかったことを記録する
• 技術情報を共有する
  • twitter に post する
  • ブログを書く
• 関連OSSプロジェクトにコミットする
  • SNSで質問する
    • hashtag をつけて twitter で
  • プロジェクトの Gitter channel があればそこで聞く
  • Issueを立てる
  • Pull Request を送る
• その他データ解析に関わる人々の日々の暮らしが豊かになる開発を進める

まとめ

石井

ハンズオン完走できてよかった！

那須野

IAMのAccess Analyzerがよかった！

池田

Access Analyzer の結果を見てみたい。

山中

HealthOmics の作り込みにびっくりした。

山本

IAMのAccess Analyzerがよかった！

濱田

質問でみんながどこを気にするのかがわかった。

大田

すべてが大変よかった。

丹生

HealthOmicsでGATKが出す行儀悪いWFをどう叩くのか？が気になる。

末竹

IaaSしんどいのでHealthOmicsがよい

福井

Cfが楽しい！

鳥羽

たくさん議論できてよかった workflow-meetup のページに AWS がなかった！

中島

Batchの感想が欲しい！

宮本

PC/Batch などの柔軟なサービスもぜひ！質問が深かった。

小泉

対面だと細かい質問が聞けるのがとてもよかった。