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Pitagora Meetup 2025-

概要

• 日時： 2025年5月15日（木） 13:00 〜 18:00
• 場所：
  • オンサイト会場:
    • 人数制限があるため、オフライン参加を希望する方はお問い合わせください
    • COVID19 感染対策にご協力ください。
  • オンライン会場:
    • Discord: Pitagora / Workflow Meetup Japan サーバ

問い合わせ

• 幹事: 大田 tazro.ohta [at] chiba-u.jp

タイムテーブル

途中参加、途中退出は自由です。初めて参加される方はぜひ 過ごし方ガイド をご覧ください。

Time
13:00-13:15	今日の作業確認
13:15-17:00	開発とディスカッション
17:00-18:00	ラップアップ
18:00-	有識者会議

ミートアップの主旨

• データ解析ツール・ワークフローを共有する
  • ソフトウェアをコンテナ化する
  • Galaxy や CWL などを使ってツール定義、ワークフロー定義を書く
  • ドキュメントを書いて GitHub で公開する
• 共有されたツールやワークフローを実行する
  • うまくいったこと、うまくいかなかったことを記録する
• 技術情報を共有する
  • twitter に post する
  • ブログを書く
• 関連OSSプロジェクトにコミットする
  • SNSで質問する
    • hashtag をつけて twitter で
  • プロジェクトの Gitter channel があればそこで聞く
  • Issueを立てる
  • Pull Request を送る
• その他データ解析に関わる人々の日々の暮らしが豊かになる開発を進める

まとめ

末竹

• DDBJ Search の mtg.
  • ゲホンゲホン
• NBDC ヒトデータベースのバックエンドを作っている
  • データの正規化やクレンジング作業を延々としている
• Zuke (DBCLS Backup system) を動かし始めたため、それのサポート
• DFAST の実装は大体完成したため、詰め作業をしている

大田

• Meetup のスケジュールを決めておく => 第一木金を交互にやってみます, 6月は金曜 6/6
• 久々の workflow 仕事, vibe coding でやっていく
  • GPT が既に CWL をいい感じに書いてくれる
  • Zed の AI coding を試した: local ollama on macbook air だとパフォーマンスが足りないのでGPUがほしい
• その他雑務

那須野

• RDM (Research Data Management) に関わるシステムの要件整理、など

福井

• tataki論文のIntroductionのドラフトを書いた
  • 次はdiscussion書きつつ、tataki本体をupdateしなければ。
• 自分のローカルにあるObsidian用のディレクトリを、クラウドにバックアップしておいたほうがいいのではと思っている。

横山

• オンプレ workflow + AWS フロントエンドの解析システムを構築したよ！ という話をしたかったのですがそのシステムの業務対応に追われて参加できず