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Pitagora Meetup 2026-03

概要

• 日時： 2026年03月12日（木） 13:00 〜 18:00
• 場所：
  • オンサイト会場:
    • 人数制限があるため、オフライン参加を希望する方はお問い合わせください
    • COVID19 感染対策にご協力ください。
  • オンライン会場:
    • Discord: Pitagora / Workflow Meetup Japan サーバ

問い合わせ

• 幹事: 大田 tazro.ohta [at] chiba-u.jp

タイムテーブル

途中参加、途中退出は自由です。初めて参加される方はぜひ 過ごし方ガイド をご覧ください。

Time
13:00-13:15	今日の作業確認
13:15-17:00	開発とディスカッション
17:00-18:00	ラップアップ
18:00-	有識者会議

ミートアップの主旨

• データ解析ツール・ワークフローを共有する
  • ソフトウェアをコンテナ化する
  • Galaxy や CWL などを使ってツール定義、ワークフロー定義を書く
  • ドキュメントを書いて GitHub で公開する
• 共有されたツールやワークフローを実行する
  • うまくいったこと、うまくいかなかったことを記録する
• 技術情報を共有する
  • twitter に post する
  • ブログを書く
• 関連OSSプロジェクトにコミットする
  • SNSで質問する
    • hashtag をつけて twitter で
  • プロジェクトの Gitter channel があればそこで聞く
  • Issueを立てる
  • Pull Request を送る
• その他データ解析に関わる人々の日々の暮らしが豊かになる開発を進める

まとめ

大田

• 千葉大に AWS, Google に来てもらってセミナーをしてもらった
  • Kiro, Gemini CLI をハンズオンで試してみた。Kiro は複数のモデルを動的に変更しながら使える。ロードバランサー的な。Gemini CLI は Gemini 3 だとちょっと使い物にならないので Gemini 3 Pro じゃないとだめそう。Codex (GPT Pro) と Claude Code (Max) と比較するとかなり劣るのでやはり重課金するしかない。。
• moshi (iOS) -> mosh/tailscale/tmux -> 自鯖/大学サーバ が完成した
  • moshi にも課金した
  • 7 panes くらい常時開いている
  • しょっちゅう何やってたかわからなくなるので「今ここなにやってるんだっけ」「今のレポジトリの状況どうなってる？」とか聞いてて、これって中間管理職ムーブだなと思った
• agent に言えばなんでも作ってくれるのでなんか色々 作った 作ってもらった 作って頂いた
  • https://inutano.github.io/rare-disease-globe/
  • https://github.com/inutano/amed-research-db
• Sapporo とか ChIP-Atlas とかの既存プロジェクトにも手を入れまくっている
• Claude code に言えばやってくれることばかりがどんどん進んでメールとかslackが億劫になりつつある
• AIメガネがやっと届いたが検収が済んでおらずまだ手元には来ていない……

池田

• 年度末の納品に向けて粛々と業務遂行中
• webllmでQ&Aのシステムを作ってみたけど、動作はクライアントの環境とCPUに依存するのでちょっと厳しい
• かな漢字変換で日本語を記述するより、音声認識の方が効率的だった

米澤 (初参加)

• 初参加です！
• ラップアップのときお邪魔させていただく予定です！

やっていること

• yonesora56/TEA_annotation
• The Embedded Alphabet (TEA) というタンパク質構造の特徴を捉えた独自アルファベットを使って、これまでアノテーションできなかったタンパク質をアノテーションしてみよう計画を進めています！
• 今このTEAを使ったアノテーションワークフローをCWLで作ってみています

福井

• 今日は仕事しかできなさそうです。。